Entwickler, verbundene Unternehmen und der Vornado Realty Trust beauftragten die New Yorker Niederlassung des Architekturbüros HOK, das mit den Glasdesignern James Carpenter Design Associates zusammenarbeitete, mit der Vorbereitung des neuen Projekts. Es sei darauf hingewiesen, dass dieses Büro den Ursprung des Projekts für den neuen Bahnhofskomplex bildete und bereits Anfang der neunziger Jahre eine vorläufige Version davon entwickelte. Die Originalfassung von David Childs (SOM) wurde aufgrund einer Änderung des ursprünglichen Plans abgelehnt: Jetzt bleiben die viel größeren Bereiche des Postamtes von 1914 erhalten als bisher angenommen.
Das Projekt im Wert von 818 Mio. USD wird frühestens 2011 umgesetzt. Hinter der restaurierten Fassade im Beaux-Arts-Stil befindet sich eine Zughalle mit 11 Bahnsteigen im Plan - ein Platz mit einer Seitenlänge von 43 m, daneben eine Wechselhalle (60 x 18 m), die die Bahnhof mit U-Bahn-Stationen und der Ost / West-Korridor (90 x 18 m), über den der neue Flügel des Komplexes betreten werden kann.
Sie können den Bahnhof über 33 Eingänge betreten. Es wird von rund 3.300 Personen bedient.
Über dem Gelände des Verkehrsknotenpunkts werden ein Hotel und Geschäfte entstehen. Der Bau von Wohngebäuden ist ebenfalls geplant.
Die Zughalle wird mit einem gewellten Glasdach bedeckt sein, das von Stahlsäulen getragen wird und die Passagiere an die alte Penn Station erinnern soll, die sich gegenüber der Post befand und 1963 abgerissen wurde.
Tageslicht wird auch den Innenraum durch speziell verglaste "Gräben" auf den Gehwegen in der Nähe der Außenwände der Station und durch Glasrohre beleuchten, die in den Stahlstützen des Hauptgebäudes verlegt sind.
Die neue Station wurde nach dem verstorbenen New Yorker Senator Daniel Patrick Moynihan benannt, einem aktiven Unterstützer des Projekts.
