Die Hauptausstellung zum Thema „Städte, Architektur und Gesellschaft“wird in diesem Jahr mit der Ausstellung „Städte aus Stein“in Venedig und der Ausstellung „Hafenstadt“in Palermo kombiniert.
Neu in diesem Jahr ist die Abhaltung der Hauptpreisverleihung am Ende der Biennale am 8. November 2006. Gleichzeitig werden die Preisträger des Steinlöwenpreises - hauptsächlich der venezianischen Sektion und des Portus-Architekturpreises - in der Sektion Palermo geehrt. Am Eröffnungstag, dem 10. September, erhält nur Richard Rogers den Goldenen Löwen für ihn entscheidender Beitrag zur Entwicklung der Architektur …
Der Partner der Biennale in diesem Jahr ist Risanamento SpA, das in Mailand neue Gebiete von Santa Giulia (Architekt Norman Foster) und das ehemalige Industriegebiet Falk (Architekt Renzo Piano) errichtet. Sie wird ihre Ausstellung in Venedig präsentieren, die diesen Projekten gewidmet ist. Die Ausstellung wird auch von den Firmen "Inarcassa" und "illycaffè" unterstützt. Die Firma Targetti hat in Zusammenarbeit mit der Biennale ein kreatives Beleuchtungssystem für den italienischen Pavillon, einige andere Ausstellungsräume in Venedig und alle Ausstellungen in Palermo installiert.
