Das Projekt begann im Jahr 2001: 1999 wurde die Kontrolle über den Panamakanal von den Vereinigten Staaten auf die panamaischen Behörden übertragen, und gleichzeitig stellte sich die Frage nach der neuen Nutzung der angrenzenden Gebiete. Eine der Sektionen - zuvor vom amerikanischen Luftwaffenstützpunkt besetzt - wurde einem Museum zugewiesen. Die Bauarbeiten begannen im Jahr 2006, aber erst Anfang Oktober wurde Biomuseo der Öffentlichkeit zugänglich gemacht - wenn auch noch nicht vollständig: Mehrere Hallen und ein Aquarium werden erst im Winter 2016 fertig sein.
Mit seinem farbenfrohen Aluminiumdach soll das Museum an die pulsierende Natur Panamas, die Metalldächer lokaler Hütten und die historischen Strukturen der Kanalinfrastruktur erinnern. Das Gebäude befindet sich auf einer schmalen Halbinsel, die in die Bucht hineinragt. Es ist von weitem sichtbar und bietet seinen Besuchern einen Panoramablick auf die Stadt und die pazifische "Mündung" des Panamakanals.
Die Dauer des Baus des Museums, das von den Einheimischen als "das Museum, das niemals fertiggestellt werden wird" bezeichnet wird, erklärt sich unter anderem aus den geringen Qualifikationen der örtlichen Bauherren. Der raue Beton der Böden und Wände musste viele Male nachgegossen werden, und auch das Dach mit Toleranzen von 6 mm war mit vielen Schwierigkeiten verbunden.
Jetzt ist das Museum jedoch nicht nur erfolgreich gebaut, sondern fast vollständig mit der Ausstellung "Die Brücke des Lebens" gefüllt, die von Bruce Mau entworfen wurde. Die Smithsonian Institution in Washington war für die wissenschaftliche Seite des Projekts verantwortlich, und Biomuseo wurde das einzige Partnermuseum außerhalb der USA.
Das Museum widmet sich der erstaunlichen natürlichen Vielfalt der Landenge von Panama: Mit einer Fläche von 75.000 km2 beherbergt es mehr Arten von Vögeln, Säugetieren, Reptilien und Pflanzen als in den USA und Kanada zusammen. Darüber hinaus erzählt die Ausstellung ausführlich über den Prozess der Isthmusbildung, der vor 12 Millionen Jahren begann und vor 3 Millionen Jahren endete. Sein Aussehen veränderte die Ökosysteme und das Klima auf planetarischer Ebene: Anstelle eines einzigen Ozeans entstand ein ganz anderer Atlantik und Pazifik, der Golfstrom "startete" vom aufstrebenden Karibischen Meer und Nord- und Südamerika vereinigten sich zum ersten Mal seit 70 Millionen Jahre. Eine aktive Migration von Tieren begann entlang der Landenge, und vor relativ kurzer Zeit, vor 15.000 Jahren, passierten die ersten Menschen diese Route von Nord nach Süd.
Biomuseo, das 95 Millionen US-Dollar kostet (ohne die Kosten für noch nicht fertiggestellte Ausstellungshallen), ist in erster Linie für Schulkinder (es ist geplant, jährlich 40.000 Studenten für kostenlose Ausflüge dorthin zu bringen) und für Touristen konzipiert, da sich das Kreuzfahrtterminal befindet sehr nah. Im Idealfall erwarten die Behörden vom Museum den "Bilbao-Effekt". Nach ihrem Plan sollte es das gleiche Symbol für Panama-Stadt und Panama-Land werden, das Utsons Opernhaus für Sydney und Australien wurde.
