Diese Entscheidung wurde als Zugeständnis an die aggressive Haltung der Familienmitglieder der während des Terroranschlags vom 11. September 2001 Getöteten getroffen. Ihrer Meinung nach sollte es an der Stelle, an der die Zwillingstürme standen, keine Institutionen geben, die die Aufmerksamkeit von dieser Tragödie ablenken könnten. Zuvor wurde angekündigt, dass nur diejenigen Kulturinstitutionen, die sich verpflichten, niemals Ausstellungen und andere Veranstaltungen abzuhalten, die die patriotischen Gefühle der Amerikaner verletzen könnten, in das Gebiet des WTC aufgenommen werden können. Infolgedessen hat das Zeichenzentrum, das ein vom norwegischen Büro Snohetta entworfenes, von der Kritik gefeiertes Gebäude mit dem Freedom Center teilen sollte, seinen Mietvertrag gekündigt und sucht nach einem anderen Raum.
So war Libeskinds Plan erneut bedroht: Seinem Projekt zufolge sollten sich in den "Drucken" der Fundamente zerstörter Wolkenkratzer neben dem Denkmal für die Opfer des Terroranschlags Kulturinstitutionen befinden. Jetzt wird das Besucherzentrum der einzige garantierte "Eigentümer" des Gebäudes sein.
Es spricht auch von Veränderungen in der Position der Behörden: Das in Ungnade gefallene Freedom Center wurde bereits 2002 als Institution konzipiert, die sich der Geschichte des weltweiten Kampfes für die persönliche Freiheit widmet.
Nach der Ankündigung der Zensur durch Gouverneur George Pataki auf dem WTC-Gelände im Juli 2005 haben viele prominente Persönlichkeiten des öffentlichen Lebens den Rat verlassen, um den Entwurf und den Bau des neuen Komplexes zu leiten. Nach Patakis letzter Entscheidung verließen mehrere weitere Personen das Land, darunter Agnes Gund, Ehrendirektorin des Museum of Modern Art und prominente Philanthropin. Analysten zufolge wird es jetzt besonders schwierig sein, Geld für den Bau des Snohetta-Gebäudes und des Michael-Arad-Denkmals zu sammeln. Somit war das Schicksal des Gebäudes in Gefahr. Die Zukunft des von Frank Gehry entworfenen Theatergebäudes ist ebenfalls ungewiss: Der Architekt beschwerte sich bei Reportern über den völligen Mangel an Kundenkontakten, und die Umsetzung des Projekts war für die "zweite Phase" der Restaurierung des World Trade Centers geplant - das heißt, in ferner Zukunft.
